RSUD Tarakan memiliki konsultan Gastroentero – Hepatologi, yaitu dokter subspesialis penyakit dalam yang ahli dalam memberikan pengobatan :
• Abses Hati
• Karsinoma
• Kista Hati
• Batu Empedu
• Tumor saluran empedu

Dengan dukungan alat alat kesehatan yang canggih seperti :
• Cath Lab
• USG 4 D
• ERCP
• MRCP

Tindakan Endoskopi di RSUD Tarakan dilakukan oleh dokter ahli penyakit Gastrohepatologi didukung system Computerized Ultraview Image Management and Reporting System.