MRI dapat menggambarkan dengan jelas dan kontras berbagai organ tubuh seperti organ pencernaan, jantung sumsum tulang belakang, susunan syaraf dan lain lain. Hasil yang didapatkan lebih jelas dibandingkan rontgen atau CT Scan.
MRI sangat membantu dokter untuk menetapkan dengan tepat diagnosa sebuah penyakit dan sangat baik digunakan untuk menilai bentuk anatomi jaringan lunak alam tubuh terutama otak, sumsum tulang belakang serta susunan saraf dan kelainan otot sendi.
Kelebihan lain menggunakan MRI adalah tidak membahayakan pasien dengan kualitas gambar lebih baik.