Klinik Spesialis dan subspesialis mata RSUD Tarakan menyediakan pelayanan diagnostic dan terapi yang lengkap dan mutakhir. Pelayanan diagnosis yang dapat dilakukan di poli mata antara lain:
1. Pemeriksaan mata dasar seperti pemeriksaan refraksi/ ukuran kaca mata baik pada anak maupun dewasa
2. Pemeriksaan deteksi kelainan pada permukaan mata seperti infeksi kelopak, tumor kelopak mata, pterygium, kelainan konjungtiva, infeksi konjungtiva, kelainan kornea, infeksi kornea, benda asing kornea, perdarahan konjungtiva
3. Pemeriksaan deteksi katarak
4. Pemeriksaan deteksi glaukoma
5. Pemeriksaan deteksi kelainan retina
6. Pemeriksaan deteksi penyakit akibat prematuritas
7. Pemeriksaan deteksi penyakit akibat trauma mata

Poli mata juga didukung oleh alat penunjang yang mutakhir untuk melakukan deteksi penyakit yaitu
1. Autorefractometer untuk kelainan refraksi myopia, hypermetropia, maupun astigmatisme
2. Streak retinoscopy untuk pemeriksaan kelainan kaca mata pada anak dan bayi
3. Tonometry untuk pemeriksaan tekanan bola mata dan mendeteksi glaucoma
4. Indirect ophthalmoscope untuk melihat bagian retina perifer.
5. Fundus Photo untuk dokumentasi kelainan permukaan retina
6. Ultrasonografi mata untuk melihat kelainan pada perdarahan atau kekeruhan vitreus
7. Optical Coherence Tomography untuk melihat ketebalan retina dan kelainan macula serta deteksi glauckoma
8. Biometri untuk mengukur ukuran lensa tanam pada operasi katarak
9. Anel test untuk deteksi adanya sumbatan pada saluran air mata
10. Schirmer test untuk melihat jumlah produksi air mata
11. Fluorescent test untuk melihat kelainan defek kornea dan kualitas air mata

Tindakan yang dapat dilakukan di klinik mata adalah :
1. Tindakan bedah minor seperti insisi kalazion, ekstraksi benda asing kornea, scrapping conjunctiva, epilasi.
2. Tindakan bedah akibat katarak yaitu Intracapsular cataract extraction (ICCE), Extracapsular cataract extraction (ECCE), Phacoemulsification
3. Tindakan laser seperti Capsulotomy, iridotomy, laser fotokoagulasi untuk kelainan retina dan glaukoma
4. Tindakan bedah glaucoma seperti trabekulektomi dan iridektomi perifer
5. Eksisi tumor konjungtiva dan pelpebra
6. Avulsi pterigium
7. Repair bola mata/bulbus okuli akibat trauma
8. Implantasi lensa tanam
9. Tindakan bedah retina seperti :
a. Vitrektomi
b. Scleral buckling
c. Pneumatic retinopexy
d. Injeksi intravitreal
10. Eviserasi
11. Enukleasi