Jumlah pasien kanker di Indonesia semakin hari semakin bertambah. Untuk mengakomodasi kebutuhan tersebut, maka salah satu layanan unggulan yang ditawarkan oleh RS Tarakan Jakarta adalah Pusat Layanan Onkologi Terpadu untuk pasien-pasien yang menderita kanker.
RSUD Tarakan Jakarta adalah Rumah Sakit tipe A, yang merupakan Rumah Sakit pusat rujukan Pemerintah Provinsi DKI Jakarta. Tidak hanya melayani warga DKI Jakarta, RSUD Tarakan Jakarta juga melayani pasien kanker rujukan dari rumah sakit seluruh provinsi di Indonesia.
Berdiri sejak tahun 2014, Pusat Layanan Onkologi Terpadu RSUD Tarakan Jakarta menawarkan pelayanan pasien kanker secara holistik.
Layanan yang diberikan antara lain :
1. Deteksi dini;
2. Diagnosis;
3. Terapi bedah kanker;
4. Terapi sistemik kanker (kemoterapi, terapi hormonal, terapi target, imunoterapi);
5. Terapi suportif yang diperlukan untuk pasien kanker.

Pusat Layanan Onkologi Terpadu RS Tarakan Jakarta ditangani oleh tim multidisiplin yang terdiri dari :
1. Dokter Spesialis Penyakit Dalam Konsultan Hematologi Onkologi Medik.
Dokter Spesialis Penyakit Dalam Konsultan Hematologi Onkologi Medik (SpPD-KHOM) memberikan pelayanan kanker pada pasien dewasa, baik kanker darah (leukemia, limfoma maligna, multiplr myeloma, dll) maupun kanker padat (kanker kepala leher, payudara, kanker sistem pencernaan, kulit, jaringan lunak & tulang, paru, ginekologi, genitalia pria, sistem saluran kemih, dan serta kanker padat lainnya. Sistem kerja Dokter Spesialis Penyakit Dalam Konsultan Hematologi Medik mengedepankam sistem kerja tim multidisiplin, bekerja sama dengan Dokter Spesialis Bedah sesuai organ yang terlibat, Spesialis Patologi Anatomi, Spesialis Radiologi, Spesialis Patologi Klinik, Spesialis Radioterapi dan Spesialis lainnya yang terkait dengan keganasan masing-masing pasien.
Tugas seorang Dokter Spesialis Penyakit Dalam Konsultan Hematologi Onkologi Medik adalah memberikan kemoterapi, terapi hormon, terapi target, imunoterapi, mulai dari persiapan pasien, memberian obat, pemantauan efek samping terapi, sampai evaluasi setelah terapi selesai diberikan, yang dilandasi oleh ilmu dasar Penyakit Dalam. Dengan adanya landasan ilmu dasar Penyakit Dalam, maka keadaan sistemik semua organ pasien dapat lebih terpantau dengan baik.
2. Dokter Spesialis Anak Konsultan Hematologi Onkologi;
Dokter Spesialis Anak Konsultan Hematologi Onkologi memberikan pelayanan kepada pasien anak – anak dengan kasus keganasan seperti :
- Kanker darah / Leukimia
- Tumor Sel Germinal
- Kanker Kelenjar Getah Bening
Poliklinik Hematologi Onkologi Anak memiliki fasilitas Ruang Kemoterapi untuk melakukan tindakan kemoterapi dengan pembiusan dan ditunjang dengan layanan Radiologi ( USG, CT Scan Kontras & Non Kontras, MRI Kontras & Non Kontras), Laboratorium, Patologi Anatomi dan Bank Darah.
3. Dokter Konsultan Bedah Onkologi;
4. Dokter Konsultan Bedah Digestif;
5. Dokter Obstetri Ginekologi Konsultan Onkologi;
Dokter Obstetri Ginekologi Konsultan Onkologi memberikan pelayanan kepada pasien- pasien wanita dengan kasus keganasan pada alat reproduksi wanita. Layanan ini ditangani oleh Dokter Spesialis Kebidanan dan Kandungan Subspesialis Onkologi, Dokter Spesialis dan Perawat Onkologi serta tenaga pendukung lainnya.
Kasus – kasus yang ditangani antara lain :
- Kanker Leher Rahim / Serviks
- Kanker Indung Telur / Ovarium
- Kanker Endometrium
- Kanker Vulva
- Penyakit Tropoblast Ganas (PTG)
Tindakan bedah obstetri ginekologi onkologi yang dapat dilakukan oleh RSUD Tarakan, antara lain :
- Histerektomi Total
- Histerektomi Radikal
- Histerektomi Operatif
- Laparoskopi Operatif
- Laparotomi Staging
- Vulvektomi Radikal
- Limphadenektomi
RSUD Tarakan memiliki kerjasama rujukan pelayanan dengan RSUD Pasar Minggu bagi pasien yang membutuhkan layanan radioterapi. Radioterapi adalah teknik pengobatan yang menggunakan radiasi berenergi tinggi untuk membunuh sel kanker di dalam tubuh pasien.